Bir profesör yanlışlıkla antik Japon şeytanları Gökgürültüsü ve Şimşek?i harekete geçirir. Bunun üzerine Paranormal Araştırmalar ve Savunma Bürosu bu işin izini sürmek için bir takım kurar. Lanetli bir samuray kılıcı Hellboy?u (Ron Perlman) hayaletlerin, canavarların ve karmaşık derebeyliklerin bulunduğu doğaüstü bir boyuta gönderir. Pirokinetik Liz Sherman (Selma Blair) ve Balıkadam Abe Sapien (Doug Jones) son derece kızgın bir ejdere karşı savaşırken, kayıp ve sersemlemiş Hellboy da eve dönüş yolunu bulmakla uğraşmaktadır.